15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0324 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  50.49 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  48.04 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  50.98 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  50.98 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  49.55 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  42.62 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  49.14 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  39.32 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  34.86 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  38.24 
 
 		 313 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  41.33 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  49.15 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>