15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1220 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  221  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  48.04 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  50.47 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  49.02 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  50.47 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  46.08 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  44.76 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  43.1 
 
 		 185 aa  88.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  40.71 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  38.74 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  40.54 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  30.39 
 
 		 313 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>