15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3703 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  219  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  89.19 
 
 		 111 aa  201  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  59.6 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  52.38 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  45.45 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  43.1 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  43.1 
 
 		 185 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  40.54 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  34.55 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  42.62 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  32.65 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>