15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3474 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  239  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  34.86 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  35.9 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  39.62 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  37 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  34.55 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  39.47 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  30.91 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  33.64 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  34.29 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  35.53 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  35.19 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  35.29 
 
 
185 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>