15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3981 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  224  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  89.19 
 
 
111 aa  201  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  49.55 
 
 
111 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  50.47 
 
 
107 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  48.57 
 
 
128 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  45.45 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  42.24 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  44.83 
 
 
185 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  36.67 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  40.54 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  33.64 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  38.57 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  34.4 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  34.62 
 
 
313 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>