37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2205 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2205  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2288  hypothetical protein  88.89 
 
 		 252 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0844  hypothetical protein  53.19 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.217797 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3099  hypothetical protein  52.57 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2848  hypothetical protein  54.51 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2733  hypothetical protein  52.36 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0456  hypothetical protein  35.17 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0149  hypothetical protein  33.85 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4611  hypothetical protein  33.47 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186896  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0027  hypothetical protein  34.77 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0927357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0880  hypothetical protein  31.62 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0236  hypothetical protein  32.17 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0533  hypothetical protein  33.07 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0185  hypothetical protein  29.11 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4040  hypothetical protein  31.56 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0207  hypothetical protein  31.47 
 
 		 266 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0244  hypothetical protein  30.56 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3546  hypothetical protein  28.75 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0773  hypothetical protein  30.74 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000201228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0603  hypothetical protein  31.62 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00913835  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0824  hypothetical protein  30.74 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00076191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0742  hypothetical protein  29.11 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0806  hypothetical protein  28.63 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0604  hypothetical protein  29.54 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2641  hypothetical protein  30.2 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3096  hypothetical protein  30.9 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.573393  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3533  hypothetical protein  31.98 
 
 		 328 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5287  hypothetical protein  31.62 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00255975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1904  hypothetical protein  26.34 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2257  hypothetical protein  26.34 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2486  hypothetical protein  27.95 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.720158 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0241  hypothetical protein  25.75 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000757436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0530  hypothetical protein  26.84 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0704  hypothetical protein  22.82 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0968  hypothetical protein  21.77 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal  0.448302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>