37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0799 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0799  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186896  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4611  hypothetical protein  88.97 
 
 		 263 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0880  hypothetical protein  77.74 
 
 		 266 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0244  hypothetical protein  69.2 
 
 		 265 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0742  hypothetical protein  72.8 
 
 		 261 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0806  hypothetical protein  70.59 
 
 		 259 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0185  hypothetical protein  66.16 
 
 		 263 aa  345  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2486  hypothetical protein  43.08 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.720158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3096  hypothetical protein  37.71 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.573393  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5287  hypothetical protein  37.92 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00255975  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0773  hypothetical protein  35.12 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000201228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0603  hypothetical protein  37.29 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00913835  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0824  hypothetical protein  35.12 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00076191  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4040  hypothetical protein  33.76 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0236  hypothetical protein  35.85 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0207  hypothetical protein  36.02 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0149  hypothetical protein  34.32 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0844  hypothetical protein  35.44 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.217797 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3099  hypothetical protein  34.19 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0027  hypothetical protein  33.72 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0927357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3533  hypothetical protein  35.36 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0604  hypothetical protein  34.19 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0456  hypothetical protein  32.92 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3546  hypothetical protein  34.02 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2848  hypothetical protein  34.32 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0880  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2205  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2641  hypothetical protein  34.55 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2288  hypothetical protein  32.93 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2733  hypothetical protein  31.06 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0533  hypothetical protein  28.75 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1904  hypothetical protein  27.63 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2257  hypothetical protein  27.63 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0704  hypothetical protein  23.71 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0241  hypothetical protein  22.65 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000757436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0968  hypothetical protein  21.51 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal  0.448302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0530  hypothetical protein  22.13 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>