37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3099 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3099  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0844  hypothetical protein  58.9 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.217797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2848  hypothetical protein  56.03 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2205  hypothetical protein  52.57 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0880  hypothetical protein  52.57 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2288  hypothetical protein  52.17 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2733  hypothetical protein  51.28 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0456  hypothetical protein  33.61 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186896  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4611  hypothetical protein  34.16 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0880  hypothetical protein  32.7 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0742  hypothetical protein  33.05 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0244  hypothetical protein  32.68 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3546  hypothetical protein  31.09 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0185  hypothetical protein  32.79 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0806  hypothetical protein  31.49 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0236  hypothetical protein  30.67 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0149  hypothetical protein  30.38 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0207  hypothetical protein  30.21 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4040  hypothetical protein  29.71 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2641  hypothetical protein  30.24 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0027  hypothetical protein  32 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0927357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0603  hypothetical protein  31.2 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00913835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0773  hypothetical protein  29.29 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000201228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0824  hypothetical protein  29.29 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00076191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3533  hypothetical protein  32.56 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2486  hypothetical protein  33.19 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.720158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0533  hypothetical protein  28.45 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0604  hypothetical protein  27.9 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1904  hypothetical protein  27.94 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2257  hypothetical protein  27.94 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5287  hypothetical protein  31.91 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00255975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0968  hypothetical protein  23.69 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal  0.448302 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0241  hypothetical protein  24.44 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000757436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0530  hypothetical protein  27.66 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3096  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.573393  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0704  hypothetical protein  24.68 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>