37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0185 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0185  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0244  hypothetical protein  84.91 
 
 
265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0806  hypothetical protein  76.47 
 
 
259 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0382507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0742  hypothetical protein  72.92 
 
 
261 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0880  hypothetical protein  68.08 
 
 
266 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0799  hypothetical protein  66.16 
 
 
263 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186896  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4611  hypothetical protein  69.87 
 
 
263 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51666  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2486  hypothetical protein  44.84 
 
 
265 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.720158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3096  hypothetical protein  39.41 
 
 
272 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.573393  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5287  hypothetical protein  40.83 
 
 
255 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00255975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0207  hypothetical protein  36.02 
 
 
266 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426006  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0603  hypothetical protein  36.02 
 
 
262 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00913835  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4040  hypothetical protein  32.2 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0236  hypothetical protein  35.54 
 
 
266 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537783  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0773  hypothetical protein  33.06 
 
 
263 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000201228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0824  hypothetical protein  33.06 
 
 
263 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00076191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0604  hypothetical protein  38.03 
 
 
257 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10299  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0456  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0844  hypothetical protein  35.29 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.217797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2641  hypothetical protein  35.66 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3546  hypothetical protein  34.43 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0149  hypothetical protein  30.93 
 
 
267 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0027  hypothetical protein  31.27 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0927357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2848  hypothetical protein  33.62 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3533  hypothetical protein  33.72 
 
 
328 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3099  hypothetical protein  32.37 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2288  hypothetical protein  30.68 
 
 
252 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584927  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0880  hypothetical protein  29.06 
 
 
252 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2205  hypothetical protein  29.06 
 
 
252 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0533  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2733  hypothetical protein  32.13 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1904  hypothetical protein  27.31 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2257  hypothetical protein  27.31 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0704  hypothetical protein  27.43 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0241  hypothetical protein  21.14 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000757436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0530  hypothetical protein  22.98 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0968  hypothetical protein  22.98 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal  0.448302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>