37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1904 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2257  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2486  hypothetical protein  34.65 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.720158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3546  hypothetical protein  29.13 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0604  hypothetical protein  28.94 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2733  hypothetical protein  30.37 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0806  hypothetical protein  28.99 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0880  hypothetical protein  27.49 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2641  hypothetical protein  28.89 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0244  hypothetical protein  28.15 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0456  hypothetical protein  26.75 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3099  hypothetical protein  28.38 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3533  hypothetical protein  26.5 
 
 		 328 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0185  hypothetical protein  27.31 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0742  hypothetical protein  26.47 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0880  hypothetical protein  26.46 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0799  hypothetical protein  27.63 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186896  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0844  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.217797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2205  hypothetical protein  26.46 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120811  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4611  hypothetical protein  27.73 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2288  hypothetical protein  26.58 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0236  hypothetical protein  27.35 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0207  hypothetical protein  28.21 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4040  hypothetical protein  25.71 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0533  hypothetical protein  26.95 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0530  hypothetical protein  25.96 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2848  hypothetical protein  26.58 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0773  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000201228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0027  hypothetical protein  25.73 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0927357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0603  hypothetical protein  26.18 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00913835  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0824  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00076191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0149  hypothetical protein  26.09 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3096  hypothetical protein  27.23 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.573393  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0704  hypothetical protein  26.72 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0968  hypothetical protein  21.66 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal  0.448302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5287  hypothetical protein  26.51 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00255975  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0241  hypothetical protein  19.21 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000757436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>