36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0530 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0530  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0968  hypothetical protein  36.71 
 
 
275 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal  0.448302 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2257  hypothetical protein  25.96 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1904  hypothetical protein  25.96 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3099  hypothetical protein  27.66 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199405  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0704  hypothetical protein  30.17 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2848  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2288  hypothetical protein  27.57 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584927  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0533  hypothetical protein  25.54 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2205  hypothetical protein  26.84 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0880  hypothetical protein  26.84 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0844  hypothetical protein  26.22 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.217797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0185  hypothetical protein  22.98 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0456  hypothetical protein  24.89 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2733  hypothetical protein  27.8 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1314  hypothetical protein  21.6 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0244  hypothetical protein  22.37 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2641  hypothetical protein  23.08 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0880  hypothetical protein  23.11 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0149  hypothetical protein  22.08 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0207  hypothetical protein  24.24 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426006  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0236  hypothetical protein  24.24 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537783  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0604  hypothetical protein  22.94 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10299  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4611  hypothetical protein  22.58 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51666  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0027  hypothetical protein  24.12 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0927357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2486  hypothetical protein  25.1 
 
 
265 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.720158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0799  hypothetical protein  23.39 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186896  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3546  hypothetical protein  20.9 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0603  hypothetical protein  23.91 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00913835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0773  hypothetical protein  21.79 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000201228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3533  hypothetical protein  25.76 
 
 
328 aa  45.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0742  hypothetical protein  21.49 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0824  hypothetical protein  21.79 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00076191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0806  hypothetical protein  20.6 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0382507 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0241  hypothetical protein  22.18 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000757436  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4040  hypothetical protein  22.17 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>