37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0244 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  534  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0185  hypothetical protein  88.8 
 
 		 263 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0742  hypothetical protein  76.67 
 
 		 261 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0806  hypothetical protein  76.79 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0799  hypothetical protein  69.2 
 
 		 263 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186896  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0880  hypothetical protein  69.23 
 
 		 266 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4611  hypothetical protein  71.6 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2486  hypothetical protein  46.22 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.720158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3096  hypothetical protein  40.68 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.573393  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5287  hypothetical protein  42.5 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00255975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0207  hypothetical protein  34.33 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0603  hypothetical protein  37.29 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00913835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0236  hypothetical protein  33.58 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4040  hypothetical protein  32.37 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.60932  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0773  hypothetical protein  36.25 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000201228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0824  hypothetical protein  36.25 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00076191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0456  hypothetical protein  35.86 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2641  hypothetical protein  36.65 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0604  hypothetical protein  37.87 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0844  hypothetical protein  36.55 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.217797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3546  hypothetical protein  35.29 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0149  hypothetical protein  31.51 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3533  hypothetical protein  33.85 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0027  hypothetical protein  34.08 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0927357  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2848  hypothetical protein  31.62 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2288  hypothetical protein  30.28 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2733  hypothetical protein  32.58 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0880  hypothetical protein  30.21 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2205  hypothetical protein  30.21 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0533  hypothetical protein  30.83 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1904  hypothetical protein  28.15 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2257  hypothetical protein  28.15 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0704  hypothetical protein  27.24 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0241  hypothetical protein  22.32 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000757436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0968  hypothetical protein  22.18 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal  0.448302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0530  hypothetical protein  22.13 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>