18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3687 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  85.71 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  84.21 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  67.07 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  86.54 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  71.19 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  70.18 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  69.81 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  64.15 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  67.35 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  62.96 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  62.96 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  60.34 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2919  hypothetical protein  60.98 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1707  hypothetical protein  46.05 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032901  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4339  hypothetical protein  47.37 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.428453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0669  hypothetical protein  46.05 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  40.85 
 
 		 221 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>