15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4173 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  213  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  91.23 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  89.29 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  70 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  85.71 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  71.93 
 
 		 58 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  71.93 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  67.92 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  69.64 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  64.81 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  64.81 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  67.35 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  63.79 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2919  hypothetical protein  58.54 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4339  hypothetical protein  49.23 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.428453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>