15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0144 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  96.67 
 
 		 60 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  72.73 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  66.67 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  68.52 
 
 		 58 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  64.81 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  64.71 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  64.15 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  62.96 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  60.38 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  59.26 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  65.31 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1812  hypothetical protein  46.94 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682081  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  57.89 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5493  hypothetical protein  47.83 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478919  normal  0.0625876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>