16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2392 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  85.96 
 
 		 58 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  71.93 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  76.47 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  66.67 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  66.67 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  69.81 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  65.45 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  61.4 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  64.81 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  66.04 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  69.39 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1812  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682081  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  57.41 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5493  hypothetical protein  40.68 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478919  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2226  hypothetical protein  52.94 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282433  decreased coverage  0.00277707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>