16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2293 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  200  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  72.73 
 
 
60 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  72.73 
 
 
60 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  60.81 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  66.04 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  64.41 
 
 
58 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  65.45 
 
 
58 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  62.5 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  64.71 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  62.26 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  64.15 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  67.35 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  62.26 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2919  hypothetical protein  49.32 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0669  hypothetical protein  46.05 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1707  hypothetical protein  48 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032901  normal  0.152048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>