14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1874 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  89.29 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  92.31 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  66.27 
 
 		 100 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  83.93 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  66.04 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  67.8 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  67.86 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  62.96 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  62.96 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  66.04 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  63.27 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  58.62 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2919  hypothetical protein  46.75 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>