14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3492 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  89.29 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  71.6 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  94.23 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  85.71 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  66.1 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  67.27 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  62.26 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  64.81 
 
 		 58 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  59.26 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  59.26 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  65.31 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  56.45 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2919  hypothetical protein  42.53 
 
 		 178 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>