23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0032 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0032  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2392  hypothetical protein  71.93 
 
 
58 aa  76.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549885  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0259  hypothetical protein  73.21 
 
 
58 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840345  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3687  hypothetical protein  72.22 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.554257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6333  hypothetical protein  65.52 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6405  putative histone H1-like protein  69.39 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3492  hypothetical protein  67.27 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751192  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0144  hypothetical protein  64.81 
 
 
60 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1874  hypothetical protein  68.52 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0127  hypothetical protein  62.96 
 
 
60 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2293  hypothetical protein  62.26 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00824537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4173  hypothetical protein  72 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2226  hypothetical protein  59.62 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282433  decreased coverage  0.00277707 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2133  hypothetical protein  66.07 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1812  hypothetical protein  44.44 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2919  hypothetical protein  50.98 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0669  hypothetical protein  48.53 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1707  hypothetical protein  51.02 
 
 
174 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032901  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4339  hypothetical protein  48.33 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.428453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4467  hypothetical protein  50.94 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521059 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4293  hypothetical protein  41.18 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4403  putative transcription elongation factor  41.18 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3058  hypothetical protein  38.89 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.68422  normal  0.577888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>