84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4582 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4582  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0820  hypothetical protein  91.94 
 
 		 130 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  78.57 
 
 		 133 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3457  hypothetical protein  74.38 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0261  hypothetical protein  74.38 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0905  protein of unknown function DUF983  77.1 
 
 		 131 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0834  hypothetical protein  75.59 
 
 		 129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0767  hypothetical protein  67.44 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  55.86 
 
 		 439 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  55.86 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0674  hypothetical protein  52.46 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  54.63 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4642  hypothetical protein  53.98 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242788  normal  0.0997926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  51.16 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0609  protein of unknown function DUF983  52.07 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0724  hypothetical protein  51.18 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  51.85 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  45.74 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  54.63 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0649  protein of unknown function DUF983  52.07 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.643544  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  48.41 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  49.54 
 
 		 135 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  48.76 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  45.24 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  45.24 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  45.9 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  45.31 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  48.67 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4739  protein of unknown function DUF983  49.51 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0123069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  44.35 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  42.06 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4222  hypothetical protein  47.22 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.867791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4592  protein of unknown function DUF983  46.3 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6945  protein of unknown function DUF983  47.22 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1973  hypothetical protein  44.26 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2228  hypothetical protein  41.13 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519289  normal  0.0128796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1558  protein of unknown function DUF983  40.8 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602074  normal  0.0157873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2484  hypothetical protein  44.72 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3881  hypothetical protein  50.47 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2074  hypothetical protein  41.51 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  43.64 
 
 		 153 aa  93.2  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1400  hypothetical protein  44.12 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2765  hypothetical protein  42.73 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4734  protein of unknown function DUF983  40.48 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6977  protein of unknown function DUF983  42.59 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.906063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0563  hypothetical protein  39.25 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  32.76 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  33.02 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  28.1 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3863  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3136  hypothetical protein  36.27 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  34 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.717578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0418  hypothetical protein  32.23 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  32.84 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2074  hypothetical protein  32.23 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4500  hypothetical protein  34.45 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  37 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  31.37 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0544  hypothetical protein  29.73 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2342  hypothetical protein  32.43 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000430301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2829  hypothetical protein  39.47 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  36.89 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  36 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  29.82 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2381  hypothetical protein  34 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2658  protein of unknown function DUF983  34 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  30.77 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1169  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446143  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  30.69 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  26.77 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7412  protein of unknown function DUF983  29.7 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3981  hypothetical protein  27.52 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641842  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  26.42 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5357  hypothetical protein  31.19 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.831164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0919  hypothetical protein  27.84 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0679  hypothetical protein  55.17 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.130703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>