39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0919 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0919  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  243  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  28.33 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  27.84 
 
 		 439 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  25.96 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0905  protein of unknown function DUF983  29.66 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0609  protein of unknown function DUF983  24.79 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4222  hypothetical protein  34.83 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.867791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4592  protein of unknown function DUF983  34.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  30.95 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0820  hypothetical protein  29.06 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  27.84 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  24.58 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  35.21 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0834  hypothetical protein  28.44 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0674  hypothetical protein  26.67 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  28.32 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2484  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  28.89 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  32.69 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4582  hypothetical protein  27.84 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  28.85 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  32.58 
 
 		 124 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  27.88 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4739  protein of unknown function DUF983  31.4 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0123069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  29.81 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  28.28 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  32.18 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0649  protein of unknown function DUF983  24.76 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.643544  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2228  hypothetical protein  29 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519289  normal  0.0128796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0544  hypothetical protein  26.79 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  27.78 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3881  hypothetical protein  36.67 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1558  protein of unknown function DUF983  29.41 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602074  normal  0.0157873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  30.49 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  37.74 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  24.75 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.717578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>