84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1169 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1169  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446143  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2821  hypothetical protein  48.28 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641842  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  46.08 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3136  hypothetical protein  39.67 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3981  hypothetical protein  49.04 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881431  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  37.19 
 
 
163 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2342  hypothetical protein  45.1 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000430301  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0418  hypothetical protein  40.83 
 
 
136 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2074  hypothetical protein  40.83 
 
 
136 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271122  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  41.73 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  43.44 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  39.52 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  36.84 
 
 
149 aa  83.6  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  40.91 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2829  hypothetical protein  42.37 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  36.97 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.717578 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  35.77 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  35.77 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  37.98 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  33.63 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7412  protein of unknown function DUF983  35.17 
 
 
171 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  40 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2658  protein of unknown function DUF983  36.76 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2381  hypothetical protein  36.76 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  35.19 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3863  hypothetical protein  37.84 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  38.46 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0544  hypothetical protein  35.59 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  38.46 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  38.53 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  32.31 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  36.52 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  34.17 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  39.81 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  33.61 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  34.82 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0820  hypothetical protein  38.05 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  41.46 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0905  protein of unknown function DUF983  50 
 
 
131 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5357  hypothetical protein  33.63 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.831164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0724  hypothetical protein  39.25 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  38.83 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4582  hypothetical protein  38.68 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2074  hypothetical protein  39.58 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0159  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  33.9 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0674  hypothetical protein  34.21 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.722288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4500  hypothetical protein  45.31 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  35.92 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 
439 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0261  hypothetical protein  33.65 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3457  hypothetical protein  33.65 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2484  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159149  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0834  hypothetical protein  34.72 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0609  protein of unknown function DUF983  33.33 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1973  hypothetical protein  44.23 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0767  hypothetical protein  33.67 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12977  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0649  protein of unknown function DUF983  38.46 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.643544  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  34.75 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6945  protein of unknown function DUF983  44.9 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  42.86 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  32.11 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  43.4 
 
 
137 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6977  protein of unknown function DUF983  35.34 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.906063  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  32.71 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  38.78 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  38.89 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0679  hypothetical protein  36.11 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.130703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2228  hypothetical protein  37.1 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519289  normal  0.0128796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1558  protein of unknown function DUF983  39.39 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602074  normal  0.0157873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2765  hypothetical protein  32.61 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  36.56 
 
 
126 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4642  hypothetical protein  34.65 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242788  normal  0.0997926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0563  hypothetical protein  32.63 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4734  protein of unknown function DUF983  33.61 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1400  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4739  protein of unknown function DUF983  37.78 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0123069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3881  hypothetical protein  38.27 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868081  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4222  hypothetical protein  35.56 
 
 
168 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.867791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4592  protein of unknown function DUF983  35.56 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0893278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>