More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1535 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1535  uridylate kinase  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0462881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1714  uridylate kinase  99.59 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1802  uridylate kinase  91.7 
 
 		 241 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  68.35 
 
 		 253 aa  331  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  68.22 
 
 		 242 aa  324  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  65.27 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  65.27 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  65.27 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  65.55 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  64.85 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  64.44 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  64.44 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  63.29 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  65.24 
 
 		 247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  64.81 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  64.81 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  64.38 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  63.71 
 
 		 247 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  61.34 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  294  7e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  60.42 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  60.92 
 
 		 243 aa  291  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  60.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  61.11 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  60.08 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  60.5 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  59.66 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  59.66 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  59.66 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  59.66 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  59.66 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  58.82 
 
 		 243 aa  286  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  60.17 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  60.08 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  60.17 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  59.66 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  59.66 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  59.66 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  59.66 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  58.82 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  59.24 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  59.75 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  59 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  59.75 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  57.98 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1849  uridylate kinase  61.76 
 
 		 243 aa  271  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  54.58 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  57.26 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  56.03 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  56.84 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  54.62 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  56.84 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03235  uridylate kinase  60.08 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  53.42 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002748  uridylate kinase  60.08 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000503391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  53.42 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  53.88 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  53.75 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  53.45 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  52.92 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2425  uridylate kinase  59.24 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  53.85 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  52.99 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  53.42 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0987  uridylate kinase  58.97 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000385538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  52.99 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  54.04 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  53.31 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  53.62 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  52.92 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  52.92 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  54.31 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  51.71 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  52.5 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  52.97 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  53.62 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  53.62 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  52.34 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  52.34 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  51.67 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  51.93 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  51.93 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>