More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0105 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0105  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
329 aa  665    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000997405  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0081  hypothetical protein  61.42 
 
 
332 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0087  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.04 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0087  quinone oxidoreductase  36.42 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
326 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002527  NADPH:quinone reductase  35.28 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03489  quinone oxidoreductase  33.95 
 
 
316 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  30.67 
 
 
315 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.8 
 
 
317 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.52 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.61 
 
 
314 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  32.92 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  31.27 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.63 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
320 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.55 
 
 
337 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.31 
 
 
313 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.75 
 
 
314 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
335 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
312 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  31 
 
 
312 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.45 
 
 
639 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  33.94 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  29.85 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  31.61 
 
 
308 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.75 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.72 
 
 
314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
321 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.42 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.57 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.52 
 
 
315 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.13 
 
 
319 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.77 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.27 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.53 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.23 
 
 
334 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  27.96 
 
 
317 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  28.06 
 
 
358 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.65 
 
 
330 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  29.36 
 
 
308 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.88 
 
 
334 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.94 
 
 
331 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.22 
 
 
308 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.41 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.29 
 
 
309 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.74 
 
 
335 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.31 
 
 
307 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
309 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.25 
 
 
329 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.86 
 
 
328 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.79 
 
 
311 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  30.15 
 
 
318 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.77 
 
 
324 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
337 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  28.78 
 
 
349 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.77 
 
 
305 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.12 
 
 
331 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  26.74 
 
 
337 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  28.99 
 
 
339 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  29.44 
 
 
325 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.71 
 
 
334 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.32 
 
 
333 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3363  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
333 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.32 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  27.14 
 
 
328 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.13 
 
 
323 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.32 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.74 
 
 
314 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.61 
 
 
331 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.08 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5249  quinone oxidoreductase  32.14 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.73 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.72 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.02 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.32 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.29 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  27.81 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  27.81 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.74 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.7 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00158  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11430)  29.11 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.27 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  27.78 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  28.11 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5036  alcohol dehydrogenase  25.45 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187479  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.87 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>