286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2801 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  91.7 
 
 
241 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  90.87 
 
 
241 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  75.65 
 
 
230 aa  360  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  55.02 
 
 
244 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  45.85 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  46.22 
 
 
251 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  38.21 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  44.55 
 
 
228 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  41.96 
 
 
220 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  37.96 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  37.26 
 
 
391 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  43.06 
 
 
241 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  43.52 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  43.06 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.54 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  36.93 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  42.92 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  42.92 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  42.92 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  40.09 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.09 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  42.13 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  39.48 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  37.98 
 
 
235 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0742  hypothetical protein  42.53 
 
 
221 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.603143  normal  0.0662732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
252 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  33.04 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  37.16 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0267  hypothetical protein  36.32 
 
 
282 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6816  metallophosphoesterase  39.02 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  0.0856372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  33.04 
 
 
218 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.8 
 
 
222 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.59 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  32.59 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  33.04 
 
 
218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  33.81 
 
 
214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.59 
 
 
218 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  30.95 
 
 
221 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  30.95 
 
 
221 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  33.48 
 
 
218 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  29.2 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0055  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
284 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  35.92 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  35.44 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  31 
 
 
267 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.44 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  35.44 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  31 
 
 
196 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  34.95 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  35.44 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  35.44 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0491233 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  36.16 
 
 
244 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  34.95 
 
 
218 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.17017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.95 
 
 
218 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.95 
 
 
218 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.95 
 
 
218 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.95 
 
 
218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  32.38 
 
 
229 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.48 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  35.61 
 
 
294 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  35.61 
 
 
216 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  35.61 
 
 
216 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  35.61 
 
 
216 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  35.12 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50 
 
 
294 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
293 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1050  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.209296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3178  serine/threonine protein phosphatase  43.06 
 
 
101 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  45.21 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.77 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.77 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  27.48 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  27.39 
 
 
356 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
288 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
288 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  27.89 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61419  predicted protein  34.65 
 
 
327 aa  55.5  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00456855  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  49.23 
 
 
265 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.44 
 
 
287 aa  55.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00890  phosphoric monoester hydrolase, putative  36.76 
 
 
543 aa  55.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  47.89 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03793  Serine/threonine protein phosphatase (EC 3.1.3.16) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1ANE5]  32.31 
 
 
512 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213434  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  25 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  30.4 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01720  protein serine/threonine phosphatase, putative  33.06 
 
 
499 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  47.62 
 
 
293 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  29.82 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  29.15 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  36.62 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  25 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  31.87 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1753  metallophosphoesterase  45.45 
 
 
336 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>