278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3020 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  97.1 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  91.7 
 
 		 241 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  75.77 
 
 		 230 aa  357  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  53.25 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  45.61 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  45.34 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  44.29 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  40.44 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  41.52 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  37.04 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  36.55 
 
 		 391 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  41.67 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  41.44 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.89 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  41.44 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.44 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  36.1 
 
 		 279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  41.28 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  41.28 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  40.99 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  40.99 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  40.99 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  40.74 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  39.91 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  36.02 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  38.46 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0742  hypothetical protein  42.01 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.603143  normal  0.0662732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6816  metallophosphoesterase  39.01 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  0.0856372 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  32 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.64 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.43 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.43 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  37.38 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0267  hypothetical protein  35.38 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142741 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  31.56 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  31.56 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  31.56 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.43 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  32.5 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  36.41 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  36.89 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  36.89 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.89 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  36.89 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  36.89 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0491233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  35.92 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.17017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.43 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0055  metallophosphoesterase  29.66 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.65 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.65 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.65 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.2 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  34.53 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.2 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  34.63 
 
 		 294 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  35.12 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  33.97 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  35.12 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  34.63 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  31.78 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  48.96 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1050  metallophosphoesterase  48.05 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3178  serine/threonine protein phosphatase  43.06 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  45.21 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.91 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.91 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01720  protein serine/threonine phosphatase, putative  33.88 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  30.49 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  24.31 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03793  Serine/threonine protein phosphatase (EC 3.1.3.16) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1ANE5]  33.61 
 
 		 512 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.31 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  24.31 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  33.8 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  49.23 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00890  phosphoric monoester hydrolase, putative  36.76 
 
 		 543 aa  55.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.44 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1753  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  47.89 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61419  predicted protein  32.5 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00456855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  47.62 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  27.37 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  31.2 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  37.68 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  38.96 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  36.62 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  34.67 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  33.06 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  39.13 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  33.08 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62390  Serine/threonine protein phosphatase 2A  31.88 
 
 		 370 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.743618  normal  0.385714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>