296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2725 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  100 
 
 
230 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  75.65 
 
 
241 aa  360  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  76.65 
 
 
241 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  75.77 
 
 
241 aa  357  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  53.71 
 
 
244 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  44.78 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  44.2 
 
 
251 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  40.35 
 
 
252 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  43.87 
 
 
228 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  37.33 
 
 
335 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  39.56 
 
 
220 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  36.84 
 
 
391 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  36.22 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  40.09 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  40.09 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0267  hypothetical protein  37.26 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  39.53 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  39.53 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  39.53 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.04 
 
 
222 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
235 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  38.68 
 
 
243 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.56 
 
 
221 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.56 
 
 
221 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.19 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  38.29 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  39.51 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.11 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  38.74 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.74 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6816  metallophosphoesterase  39.02 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  0.0856372 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  30.84 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
245 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0441457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.36 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  30.36 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.8 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  33.78 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0742  hypothetical protein  39.18 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.603143  normal  0.0662732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0055  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
284 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  37.38 
 
 
244 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.4 
 
 
218 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.4 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  33.33 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  32.16 
 
 
267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.33 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  33.97 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  32.16 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0491233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  32.88 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.91 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  32.43 
 
 
218 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.17017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
229 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 
216 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 
216 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  32.87 
 
 
216 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  32.87 
 
 
294 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  32.41 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.25 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.25 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.25 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  27.8 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  27.8 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  49.49 
 
 
294 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1050  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.209296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3178  serine/threonine protein phosphatase  44.59 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  41.89 
 
 
287 aa  62.4  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
288 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
288 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 
293 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  39.19 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  45.07 
 
 
278 aa  58.9  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  43.84 
 
 
276 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
283 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  40.54 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  39.19 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  39.19 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  39.19 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 
272 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  39.19 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  39.19 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  39.19 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  47.69 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  25 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43575  predicted protein  33.33 
 
 
313 aa  56.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  39.19 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.25 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.25 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  47.62 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  37.84 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  41.18 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  41.67 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  29.82 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>