58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0742 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0742  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.603143  normal  0.0662732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  46.71 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  42.53 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  32.57 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  41.95 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  42.01 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  42.05 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  39.18 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  30.81 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  29.59 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  34.87 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  31.09 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  27.81 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  28.92 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  26.83 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.83 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.83 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  26.83 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  28.31 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  28.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  28.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.65 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  28.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  28.31 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0491233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  28.31 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.17017 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  25 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  24.55 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  26.25 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  23.95 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  23.95 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  24.28 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  23.95 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  23.95 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  23.95 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  27.27 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  26.04 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  27.92 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  24.1 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  24.1 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  24.7 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  24.7 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  24.7 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  26.62 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  26.62 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  25.3 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  27.27 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  24.85 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  24.1 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  31.19 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  30.26 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  23.98 
 
 		 218 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  23.98 
 
 		 218 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  23.98 
 
 		 218 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>