144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3689 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  100 
 
 		 335 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  41.46 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  37.66 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  38.25 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  37.33 
 
 		 230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  37.96 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0267  hypothetical protein  38.57 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  37.04 
 
 		 241 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  35.22 
 
 		 244 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  37.81 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  38.43 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  37.04 
 
 		 220 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  30.42 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  33.99 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  32.54 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  33.99 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  32.54 
 
 		 221 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  32.54 
 
 		 221 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  35.41 
 
 		 235 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  34.13 
 
 		 243 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  33.01 
 
 		 243 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  30.92 
 
 		 214 aa  96.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  37.79 
 
 		 252 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  33.01 
 
 		 218 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.81 
 
 		 222 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  31.22 
 
 		 218 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0055  metallophosphoesterase  32.37 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  33.17 
 
 		 243 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  33.17 
 
 		 243 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  33.17 
 
 		 243 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  30.15 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  30.73 
 
 		 218 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  30.46 
 
 		 196 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  30.73 
 
 		 218 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.73 
 
 		 218 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  33.01 
 
 		 218 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  31.22 
 
 		 218 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.17017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6816  metallophosphoesterase  35.26 
 
 		 252 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  0.0856372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.52 
 
 		 218 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  30.73 
 
 		 294 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  30.24 
 
 		 218 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  30.24 
 
 		 218 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0491233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.37 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  30.73 
 
 		 216 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.85 
 
 		 218 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  32.37 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  33.73 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.02 
 
 		 218 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.02 
 
 		 218 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.02 
 
 		 218 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.02 
 
 		 218 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  28.92 
 
 		 216 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  30.73 
 
 		 216 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  37.59 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  31.55 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  27.54 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.37 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  28.86 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.56 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  36.64 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.64 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.64 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0742  hypothetical protein  34.87 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.603143  normal  0.0662732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1050  metallophosphoesterase  31.16 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  41.86 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3178  serine/threonine protein phosphatase  43.59 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  35.44 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  25.9 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  31.25 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 		 234 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  30.14 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  35.44 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  35.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  35.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00890  phosphoric monoester hydrolase, putative  39.71 
 
 		 543 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.33 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  40.24 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  29.45 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  35.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  37.66 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  26.73 
 
 		 209 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 213 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09581  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.15 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  37.66 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  29.66 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  37.66 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2085  diadenosine tetraphosphatase  31.21 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  32.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  23.56 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  40 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0097  diadenosine tetraphosphatase  31.21 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  30.23 
 
 		 254 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  22.45 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>