284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2659 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  97.1 
 
 
241 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  92.58 
 
 
241 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  76.65 
 
 
230 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  52.81 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  44.98 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  44.49 
 
 
251 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  44.5 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  41.31 
 
 
252 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  42.04 
 
 
220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  37.5 
 
 
335 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  36.14 
 
 
391 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.44 
 
 
244 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  40.99 
 
 
244 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.99 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  40.99 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  41.33 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  36.1 
 
 
279 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  41.44 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  41.44 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  41.44 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  41.2 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  40.36 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  36.44 
 
 
245 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6816  metallophosphoesterase  39.46 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  0.0856372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  37.98 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0742  hypothetical protein  41.95 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.603143  normal  0.0662732 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  32 
 
 
218 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.96 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.43 
 
 
221 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  31.43 
 
 
221 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0267  hypothetical protein  35.38 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  31.56 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  31.56 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  31.56 
 
 
218 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  34.29 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  30.95 
 
 
223 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  36.89 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.43 
 
 
218 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  31 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  31 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  36.41 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.41 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  36.41 
 
 
218 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  35.92 
 
 
218 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  36.41 
 
 
218 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0491233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  36.41 
 
 
218 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  35.44 
 
 
218 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.17017 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0055  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
284 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.2 
 
 
218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.2 
 
 
218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.2 
 
 
218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  34.98 
 
 
244 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  33.49 
 
 
229 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.76 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  28.76 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  34.63 
 
 
294 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  35.12 
 
 
216 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  35.61 
 
 
216 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  35.12 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  35.12 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50.53 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1050  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.209296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3178  serine/threonine protein phosphatase  43.06 
 
 
101 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  46.58 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.91 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.91 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01720  protein serine/threonine phosphatase, putative  34.71 
 
 
499 aa  58.9  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  30.94 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  52.38 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03793  Serine/threonine protein phosphatase (EC 3.1.3.16) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1ANE5]  34.45 
 
 
512 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213434  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  24.4 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
254 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  37.33 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  24.4 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  27.89 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  31.22 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  33.8 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  47.89 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  50.79 
 
 
288 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61419  predicted protein  32.48 
 
 
327 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00456855  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1124  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  23.39 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62390  Serine/threonine protein phosphatase 2A  33.33 
 
 
370 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.743618  normal  0.385714 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00890  phosphoric monoester hydrolase, putative  36.76 
 
 
543 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  47.62 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1217  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  23.39 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  33.87 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1286  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  23.39 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  40.26 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  36.62 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1105  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  23.39 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1099  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  23.39 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  49.21 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>