296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3742 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  99.59 
 
 
241 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  88.33 
 
 
243 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  87.92 
 
 
243 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  88.33 
 
 
243 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  88.33 
 
 
243 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  82.85 
 
 
243 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  63.33 
 
 
244 aa  295  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  63.33 
 
 
244 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  63.33 
 
 
244 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  61.7 
 
 
245 aa  289  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  62.92 
 
 
244 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6816  metallophosphoesterase  60.62 
 
 
252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  0.0856372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  60.91 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  43.06 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  40.09 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  41.28 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  38.99 
 
 
244 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  39.55 
 
 
220 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.07 
 
 
294 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166944  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  32.59 
 
 
244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  34.39 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  33.82 
 
 
228 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1050  metallophosphoesterase  37.85 
 
 
259 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.209296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  33.65 
 
 
252 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  34.29 
 
 
221 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  34.29 
 
 
221 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  33.33 
 
 
223 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.66 
 
 
222 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  33.99 
 
 
335 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
391 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  33.5 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  32.52 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  32.63 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  33.82 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  37.02 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.85 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.37 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  32.37 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  33.5 
 
 
218 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0055  metallophosphoesterase  32.05 
 
 
284 aa  95.9  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  36.54 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  36.54 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 
218 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  33.33 
 
 
218 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0491233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  33.33 
 
 
218 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.33 
 
 
218 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  36.06 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  36.06 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  32.35 
 
 
218 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.17017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  36.06 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0267  hypothetical protein  31.94 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142741 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  32.32 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  32.32 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.04 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.77 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.77 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.77 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.62 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  51.28 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  30.29 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  31.22 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3178  serine/threonine protein phosphatase  45 
 
 
101 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  44.68 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0404  metallophosphoesterase  30.52 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  47.95 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  51.56 
 
 
293 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  44.74 
 
 
286 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  53.12 
 
 
283 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  51.56 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  51.56 
 
 
288 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  48.61 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  46.84 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04647  diadenosine tetraphosphatase  43.02 
 
 
318 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  31.03 
 
 
356 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
288 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4629  diadenosine tetraphosphatase  47.3 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  30.87 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0666  diadenosine tetraphosphatase  44.19 
 
 
344 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  46.27 
 
 
287 aa  58.9  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
272 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3575  diadenosine tetraphosphatase  43.59 
 
 
289 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1753  metallophosphoesterase  50 
 
 
336 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3446  diadenosine tetraphosphatase  43.59 
 
 
289 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0774  diadenosine tetraphosphatase  43.59 
 
 
289 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0469096  normal  0.0479876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  41.03 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.27 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  45.33 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.27 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  41.1 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  41.03 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  41.25 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>