130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3178 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3178  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
101 aa  210  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0594  metallophosphoesterase  44.3 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.78 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1928  metallophosphoesterase  49.32 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.195109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6816  metallophosphoesterase  46.99 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  0.0856372 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4174  metallophosphoesterase  47.22 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  49.35 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3742  metallophosphoesterase  45 
 
 
241 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0992738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5568  metallophosphoesterase  45 
 
 
241 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  38.46 
 
 
244 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2858  putative serine/threonine protein phosphatase  44.58 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.787973  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0903  phosphoprotein phosphatase  41.11 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  41.11 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2607  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.11 
 
 
244 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2468  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.11 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0334356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4519  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3845  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3682  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.665838  normal  0.0459512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3689  serine/threonine protein phosphatase, putative  43.59 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2725  metallophosphoesterase  44.59 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.205204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  44.58 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  42.22 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  44.87 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  46.97 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  44.87 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  44.87 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1899  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
244 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0188319  hitchhiker  0.00169257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2251  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
243 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.341883  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4899  metallophosphoesterase  44.59 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443163  hitchhiker  0.000112182 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4126  metallophosphoesterase  42.5 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0267  hypothetical protein  37.84 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  37.93 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  45.45 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  45.45 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  45.45 
 
 
223 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0055  metallophosphoesterase  41.56 
 
 
284 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  48.48 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  45.45 
 
 
293 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2659  metallophosphoesterase  43.06 
 
 
241 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.495428  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  40.79 
 
 
391 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  46.97 
 
 
218 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3020  serine/threonine protein phosphatase, putative  43.06 
 
 
241 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0217729  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2408  serine/threonine protein phosphatase 1  46.48 
 
 
214 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  46.97 
 
 
218 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2801  metallophosphoesterase  45.59 
 
 
241 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.112568  normal  0.255084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1050  metallophosphoesterase  38.04 
 
 
259 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.209296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  48.48 
 
 
218 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4610  metallophosphoesterase  40.24 
 
 
279 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  43.94 
 
 
218 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.342794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3214  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  43.94 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3027  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  43.94 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1979  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.91 
 
 
222 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0869569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  45.45 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  42.17 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3110  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  43.94 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000839203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3095  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  43.94 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168651  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  44.78 
 
 
218 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1349  serine/threonine protein phosphatase 1  34.94 
 
 
218 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.17017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  34.94 
 
 
218 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.94 
 
 
218 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  34.94 
 
 
218 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  34.94 
 
 
218 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2067  serine/threonine protein phosphatase 1  34.94 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2571  serine/threonine protein phosphatase 1  34.94 
 
 
218 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346194  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  34.94 
 
 
218 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0491233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10026  ren exclusion protein  42.86 
 
 
267 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  36 
 
 
286 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
254 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00724  hypothetical protein  44.44 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00905914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  35.14 
 
 
243 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.21 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.21 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  36.99 
 
 
275 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  36.76 
 
 
276 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.43 
 
 
251 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  34.67 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1455  diadenosine tetraphosphatase  33.77 
 
 
280 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0962  diadenosine tetraphosphatase  32.47 
 
 
280 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1558  diadenosine tetraphosphatase  31.25 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3081  diadenosine tetraphosphatase  37.14 
 
 
272 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  35.71 
 
 
283 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  34.29 
 
 
250 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  30.67 
 
 
288 aa  45.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  35.71 
 
 
283 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0860  diadenosine tetraphosphatase  38.03 
 
 
277 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  32 
 
 
265 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  35.21 
 
 
267 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2728  diadenosine tetraphosphatase  32.88 
 
 
270 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00890  phosphoric monoester hydrolase, putative  31.88 
 
 
543 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0908  diadenosine tetraphosphatase  33.33 
 
 
278 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140647  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  29.73 
 
 
273 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  30.56 
 
 
256 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  34.29 
 
 
282 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  36.11 
 
 
278 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  28.57 
 
 
272 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  32 
 
 
278 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0666  diadenosine tetraphosphatase  36.36 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  29.33 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  29.33 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  29.33 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>