79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1324 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 		 122 aa  253  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  65.57 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  62.3 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  60.66 
 
 		 122 aa  159  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0907  hypothetical protein  55.74 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.603611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.9 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1283  hypothetical protein  40.5 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00697466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  34.71 
 
 		 244 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.07 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  33.88 
 
 		 244 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.29 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2820  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.45 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.58 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3595  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.501304  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2028  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.79 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000280293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0426  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.67 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0192  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.84 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2075  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.94 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0996  hypothetical protein  29.57 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.45 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.03 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.03 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2606  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.25 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000531287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.96 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0192  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.86 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.265871  normal  0.553673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0175  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.15 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0656  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.51 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.33 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.63 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.2 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.83 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.69 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.08 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0218  hypothetical protein  29.06 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1341  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.34 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000188114  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1229  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.19 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2428  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.61 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  28.33 
 
 		 266 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  30.1 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0593  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.79 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0339  hypothetical protein  31.25 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0099147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18390  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.43 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.27 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1864  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.14 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0560  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.39 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.124562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.1 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1519  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.19 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  21.31 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.08 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.53 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 416 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0461  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.63 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0445  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.11 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1947  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.66 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0840414  hitchhiker  0.0000000000000241959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.36 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 		 411 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1694  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.81 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1187  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.7 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2220  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.17 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.86 
 
 		 439 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1088  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.82 
 
 		 127 aa  42  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000294077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1955  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.27 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2758  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.78 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000861559  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1621  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  25 
 
 		 410 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.63 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.85 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0047  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.71 
 
 		 419 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2024  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.88 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.798797  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2164  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.67 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1078  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.3 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0395702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  24.35 
 
 		 437 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1532  hypothetical protein  27.37 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000937185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>