68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2220 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2220  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.25 
 
 
113 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0393  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.22 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1531  hypothetical protein  47.37 
 
 
115 aa  97.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000104654  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  38.24 
 
 
248 aa  97.1  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2026  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.45 
 
 
118 aa  95.9  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1411  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.07 
 
 
120 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000170326  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2429  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.06 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.38 
 
 
119 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.81 
 
 
419 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.25 
 
 
109 aa  87.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2159  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.74 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1088  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.45 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000294077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.81 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1693  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.09 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1950  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.55 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0656  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.14 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.4 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  32.73 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.45 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  31.62 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.43 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.26 
 
 
439 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.82 
 
 
471 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  33.93 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1341  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.37 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000188114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.14 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.14 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0746  hypothetical protein  31.82 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1231  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.58 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000822502  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2758  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.41 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000861559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2737  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.46 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122175 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0204  hypothetical protein  29.73 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2282  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.56 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.344508  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.28 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.45 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0222  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.68 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2227  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0461  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.95 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1536  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.7 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.09 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2571  protein of unknown function DUF134  29.7 
 
 
231 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1236  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.89 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000232351  normal  0.181744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.93 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.44 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2223  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.82 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0700085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18390  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.68 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0750  hypothetical protein  29.9 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.09 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.28 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1430  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.88 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2075  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.63 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.91 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  26.88 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  33.75 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.17 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1447  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  48.78 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0850  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.47 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.11 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.78 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.52 
 
 
125 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.72 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1443  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.59 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  28.7 
 
 
244 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1447  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.04 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.180585 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  28.7 
 
 
244 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.42 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.72 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>