66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2737 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2737  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
125 aa  252  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122175 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2227  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  76.61 
 
 
122 aa  201  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0204  hypothetical protein  74.8 
 
 
121 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0222  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  55.17 
 
 
120 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0461  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.33 
 
 
117 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.02 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1411  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.07 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000170326  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.46 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  38.39 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2429  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.65 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.83 
 
 
419 aa  67  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2159  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.87 
 
 
117 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0393  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.15 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0656  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.77 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2220  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.5 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  35.14 
 
 
416 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2758  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.45 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000861559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.67 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1341  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.73 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000188114  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  30.08 
 
 
248 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2026  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.26 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.23 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.23 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1531  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000104654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1231  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.93 
 
 
174 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000822502  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1536  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.61 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  30.33 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.76 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.37 
 
 
126 aa  53.9  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.53 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1693  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.63 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.36 
 
 
471 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0746  hypothetical protein  32.14 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.84 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.23 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1950  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.09 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1088  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.46 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000294077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.69 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.58 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  32.08 
 
 
401 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  33.68 
 
 
148 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.04 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.13 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.23 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0593  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.69 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723259 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1236  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.48 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000232351  normal  0.181744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.47 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2962  hypothetical protein  35.64 
 
 
155 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0850  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  22.94 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.56 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
439 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.47 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0659  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.96 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2028  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.83 
 
 
128 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000280293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.7 
 
 
137 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2223  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.21 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0700085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2571  protein of unknown function DUF134  28.8 
 
 
231 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.39 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.45 
 
 
468 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2282  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.09 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.344508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.29 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.04 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.97 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>