64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0656 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0656  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
117 aa  239  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1341  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  81.31 
 
 
126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000188114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1231  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  47.27 
 
 
174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000822502  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2758  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.28 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000861559  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  38.33 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2220  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.14 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.19 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.3 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2571  protein of unknown function DUF134  39.2 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2429  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.58 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1411  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.82 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000170326  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0393  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.73 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.48 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.48 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1088  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.08 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000294077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.6 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1986  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.48 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.93 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2227  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.35 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  34.15 
 
 
244 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  34.75 
 
 
244 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0204  hypothetical protein  31.53 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2026  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.83 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2737  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.73 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.51 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.23 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2159  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.18 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  35.51 
 
 
416 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1536  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.55 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.87 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2420  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1531  hypothetical protein  31.82 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000104654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0222  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.95 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  28.45 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  32.14 
 
 
415 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0746  hypothetical protein  31.86 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0750  hypothetical protein  23.96 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.43 
 
 
439 aa  50.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.91 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1693  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.16 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2275  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.23 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.16 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1950  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.48 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.2 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1236  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.13 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000232351  normal  0.181744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0578  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.6 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0461  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.58 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3407  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.3 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0286119 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.2 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  28.16 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3595  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.96 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.501304  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2820  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.75 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.76 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.81 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.84 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0850  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.04 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3008  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.17 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.57 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  27.97 
 
 
266 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.19 
 
 
137 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0534  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.35 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.41 
 
 
471 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1581  hypothetical protein  26.21 
 
 
201 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>