64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3412 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 
166 aa  323  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  41.67 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.23 
 
 
156 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  45.37 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0303334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1481  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.81 
 
 
119 aa  88.2  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.13 
 
 
121 aa  84.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.34 
 
 
137 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.99 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1955  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.89 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0659  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.19 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1380  hypothetical protein  46.53 
 
 
112 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000150201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0749  hypothetical protein  40.87 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18390  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.27 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1250  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.82 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.231399  normal  0.681638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3008  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.14 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.86 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1584  hypothetical protein  38.53 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1447  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.180585 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0047  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.09 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2223  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.32 
 
 
124 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0700085  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0445  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.94 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0560  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.12 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.124562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1187  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.71 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.04 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3198  hypothetical protein  42.37 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2428  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.96 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0461  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.78 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1532  hypothetical protein  37.04 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000937185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  37.96 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0339  hypothetical protein  36.11 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0099147  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1867  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.53 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1433  hypothetical protein  42.67 
 
 
79 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1686  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.43 
 
 
120 aa  61.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 
116 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1231  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.61 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000822502  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1123  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.12 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2024  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.43 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.798797  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1982  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.19 
 
 
122 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.11 
 
 
119 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2220  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.45 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1569  hypothetical protein  33 
 
 
115 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1564  hypothetical protein  36.25 
 
 
133 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.60569  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.1 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  23.85 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0222  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.79 
 
 
120 aa  47.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  33.02 
 
 
248 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0687  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.18 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.36 
 
 
118 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2028  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.71 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000280293 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1005  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.99 
 
 
124 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0097254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1101  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.99 
 
 
124 aa  44.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.12 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0827  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.82 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1531  hypothetical protein  29 
 
 
115 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000104654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.35 
 
 
113 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0367  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.21 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0193  hypothetical protein  29.09 
 
 
112 aa  42.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1229  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.19 
 
 
131 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.91 
 
 
123 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.55 
 
 
419 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1078  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.53 
 
 
154 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0395702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2164  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.33 
 
 
110 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>