26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0512 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  100 
 
 		 147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  77.86 
 
 		 149 aa  234  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  72.6 
 
 		 150 aa  229  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  71.13 
 
 		 151 aa  221  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  66.67 
 
 		 150 aa  209  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  71.43 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  62.22 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  62.22 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  51.16 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  42.31 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  35.82 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  28.15 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  38.84 
 
 		 438 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  32.04 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  32.28 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  37.14 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  26.52 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  29.77 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  27.42 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  27 
 
 		 326 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  27.89 
 
 		 473 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  28.71 
 
 		 464 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  28.3 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  27.17 
 
 		 463 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>