25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0464 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  76.51 
 
 
150 aa  254  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  73.57 
 
 
149 aa  228  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  67.79 
 
 
150 aa  222  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  74.8 
 
 
147 aa  201  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  61.11 
 
 
163 aa  196  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  63.19 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  68.22 
 
 
167 aa  191  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  49.62 
 
 
158 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  41.55 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  28.78 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  36.51 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  37.98 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  40.38 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  36.29 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  26.21 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  35 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  30.66 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  28.35 
 
 
326 aa  57.4  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  30.51 
 
 
473 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  30.28 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  30.39 
 
 
464 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>