23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2389 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  49.64 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  48.15 
 
 		 162 aa  137  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  36.76 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  39.55 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  40.83 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  36.36 
 
 		 438 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  36.51 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  36.59 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  34.96 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  31.75 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  32.03 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  33.86 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  34.96 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  32.81 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  33.33 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  34 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  33.03 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 326 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>