24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0507 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  100 
 
 
149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  76.51 
 
 
150 aa  246  7e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  70.86 
 
 
151 aa  231  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  68.46 
 
 
150 aa  227  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  76.92 
 
 
167 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  77.62 
 
 
147 aa  215  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  65.19 
 
 
144 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  59.72 
 
 
163 aa  192  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  143  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  43.88 
 
 
155 aa  116  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  39.02 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  35.21 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  38.46 
 
 
438 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  28.06 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  37.76 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  38.1 
 
 
314 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  32.26 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  31.62 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  34.95 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  31 
 
 
158 aa  62  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  28 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  32.99 
 
 
464 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  27.1 
 
 
326 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.75 
 
 
473 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>