23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1848 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  315  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  36.76 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  34.27 
 
 
162 aa  98.6  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  37.98 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  33.05 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  31.88 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  32.63 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  32.56 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  31.5 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  28.77 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  30.28 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  26.19 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  31.36 
 
 
438 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  34.95 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  28.17 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  29.23 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  26.27 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  27.05 
 
 
314 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  33.33 
 
 
167 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  25.77 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  24.78 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  35.71 
 
 
326 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>