20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0296 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  39.55 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  49.4 
 
 
162 aa  93.6  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  33.05 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  38.64 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  33.72 
 
 
438 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  32.32 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  35.44 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  30.28 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  26 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  27.43 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  35.62 
 
 
314 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  31.87 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  26.32 
 
 
151 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  30.53 
 
 
326 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  27.78 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  25.89 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  24.35 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>