24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11733 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  312  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  41.33 
 
 
156 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  47.14 
 
 
158 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  43.48 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  38.35 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  31.25 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  30.5 
 
 
438 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  31.51 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  28.37 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  29.5 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  32.26 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  25.52 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  34 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  32.26 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  26.21 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  24.66 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  31.18 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  28.17 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  31.18 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  25 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  28.75 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  26.32 
 
 
138 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  24.21 
 
 
464 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>