34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0607 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  86.62 
 
 		 163 aa  267  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  63.89 
 
 		 150 aa  200  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  63.19 
 
 		 151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  65 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  65.19 
 
 		 149 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  66.67 
 
 		 167 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  65.29 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  54.55 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  45.14 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  40.15 
 
 		 438 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  38.24 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  37.4 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  30.6 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  36.59 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  36.73 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  38.21 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  32.35 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  29.01 
 
 		 326 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  33.08 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  35.44 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 473 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  22.63 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  22.63 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  22.63 
 
 		 459 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  26.53 
 
 		 464 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  27.84 
 
 		 466 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  27.84 
 
 		 466 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  27.84 
 
 		 466 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  27.84 
 
 		 466 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  27.84 
 
 		 466 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  26.09 
 
 		 463 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>