28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1317 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  329  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  54.55 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  50.35 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  51.52 
 
 
149 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  49.29 
 
 
150 aa  140  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  49.62 
 
 
151 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  51.52 
 
 
150 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  49.62 
 
 
155 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  52.42 
 
 
167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  48.41 
 
 
147 aa  120  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  45.83 
 
 
145 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  37.24 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  37.5 
 
 
438 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  40.83 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  39.8 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  36.05 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  33.66 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  35.61 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  29.37 
 
 
326 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  30.28 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  38.46 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.46 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  27.18 
 
 
464 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  21.74 
 
 
459 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  21.74 
 
 
459 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  21.74 
 
 
459 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>