73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1681 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1681  protein of unknown function DUF1365  100 
 
 
105 aa  220  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1972  hypothetical protein  79.35 
 
 
261 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0463  hypothetical protein  57.3 
 
 
276 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5885  hypothetical protein  52.17 
 
 
250 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192815  normal  0.239276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0235  hypothetical protein  60.29 
 
 
272 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1450  hypothetical protein  51.69 
 
 
261 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2970  hypothetical protein  48 
 
 
272 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  0.71112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2397  protein of unknown function DUF1365  48 
 
 
272 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0368  protein of unknown function DUF1365  50.75 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1054  protein of unknown function DUF1365  58.21 
 
 
256 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2938  hypothetical protein  47.22 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064452  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3432  hypothetical protein  46.24 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0491  hypothetical protein  53.73 
 
 
254 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1389  hypothetical protein  41.38 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2753  hypothetical protein  45.83 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.948566  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1090  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein  45.83 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1046  protein of unknown function DUF1365  45.05 
 
 
283 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.616737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0326  hypothetical protein  40.95 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101488  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0912  hypothetical protein  51.43 
 
 
254 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2121  protein of unknown function DUF1365  40.45 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000114198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6582  hypothetical protein  38.2 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4019  hypothetical protein  44.78 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0101  protein of unknown function DUF1365  41.57 
 
 
265 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00443517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0349  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.56 
 
 
656 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1442  protein of unknown function DUF1365  42.86 
 
 
283 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5829  hypothetical protein  43.94 
 
 
284 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1621  protein of unknown function DUF1365  44.29 
 
 
283 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2361  hypothetical protein  40.45 
 
 
242 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0413  hypothetical protein  44.12 
 
 
259 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00475452  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1870  hypothetical protein  41.67 
 
 
268 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.651772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3572  hypothetical protein  39.47 
 
 
271 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6097  hypothetical protein  37.88 
 
 
253 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0297528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1251  protein of unknown function DUF1365  35.16 
 
 
291 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00207378  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1891  protein of unknown function DUF1365  40 
 
 
264 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.66 
 
 
658 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2839  protein of unknown function DUF1365  36.89 
 
 
281 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2905  hypothetical protein  37.35 
 
 
283 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1803  protein of unknown function DUF1365  43.08 
 
 
256 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000430371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1556  hypothetical protein  34.85 
 
 
267 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  40.28 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2555  hypothetical protein  37.14 
 
 
276 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2566  hypothetical protein  37 
 
 
283 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0297  protein of unknown function DUF1365  36.17 
 
 
263 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3929  hypothetical protein  34.25 
 
 
280 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2920  hypothetical protein  37.36 
 
 
228 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4370  hypothetical protein  38.04 
 
 
259 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.686626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4843  hypothetical protein  35.38 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49195  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4457  hypothetical protein  38.04 
 
 
259 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163875  normal  0.0342696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4751  hypothetical protein  38.04 
 
 
259 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  46.15 
 
 
683 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3174  hypothetical protein  41.43 
 
 
270 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186988  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1819  hypothetical protein  34.15 
 
 
291 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1617  hypothetical protein  34.29 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0724  hypothetical protein  32.61 
 
 
273 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00450807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2024  protein of unknown function DUF1365  36.62 
 
 
265 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10454  hypothetical protein  37.88 
 
 
243 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1117  hypothetical protein  39.73 
 
 
227 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4268  protein of unknown function DUF1365  38.36 
 
 
257 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4740  hypothetical protein  39.13 
 
 
271 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  35.14 
 
 
667 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3018  hypothetical protein  35.62 
 
 
269 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4926  hypothetical protein  31.94 
 
 
269 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0957  hypothetical protein  38.36 
 
 
266 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1955  protein of unknown function DUF1365  33.72 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1327  hypothetical protein  30.25 
 
 
242 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2097  hypothetical protein  35.29 
 
 
270 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1176  protein of unknown function DUF1365  31.87 
 
 
247 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01778  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3369  hypothetical protein  28.09 
 
 
274 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0815  hypothetical protein  43.33 
 
 
264 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3032  hypothetical protein  35.21 
 
 
273 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0801667  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48601  predicted protein  32.89 
 
 
360 aa  40.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1002  hypothetical protein  30.34 
 
 
249 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.160897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>