106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2097 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2097  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3174  hypothetical protein  77.41 
 
 		 270 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3018  hypothetical protein  73.7 
 
 		 269 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2735  hypothetical protein  73.33 
 
 		 269 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4740  hypothetical protein  57.43 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1067  hypothetical protein  53.52 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0957  hypothetical protein  52.4 
 
 		 266 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1117  hypothetical protein  53.08 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1488  hypothetical protein  45.2 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2099  hypothetical protein  42.11 
 
 		 241 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1002  hypothetical protein  34.34 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.160897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01778  hypothetical protein  39.46 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2467  hypothetical protein  36.19 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0461  hypothetical protein  40.89 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1176  protein of unknown function DUF1365  40.62 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2773  hypothetical protein  37.8 
 
 		 239 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725138  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4723  protein of unknown function DUF1365  38.01 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4071  hypothetical protein  34.69 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0873  hypothetical protein  33.88 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3032  hypothetical protein  33.85 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0801667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0128  hypothetical protein  39.44 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1486  hypothetical protein  35.27 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.735841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1955  protein of unknown function DUF1365  41.74 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1483  hypothetical protein  38.02 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3369  hypothetical protein  37.31 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01432  hypothetical protein  36.95 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3380  hypothetical protein  34.87 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1313  protein of unknown function DUF1365  34.73 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.91577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3050  hypothetical protein  34.73 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3207  hypothetical protein  34.73 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1169  hypothetical protein  35.25 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1170  hypothetical protein  35.63 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3064  hypothetical protein  33.97 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1240  hypothetical protein  35.25 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1327  hypothetical protein  33.61 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1384  hypothetical protein  32.95 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4843  hypothetical protein  34.9 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2710  hypothetical protein  32.84 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.784131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2905  hypothetical protein  35.32 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3572  hypothetical protein  33.47 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1870  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0815  hypothetical protein  34.75 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1556  hypothetical protein  34.31 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2566  hypothetical protein  35.74 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0639  hypothetical protein  34.94 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000143987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2839  protein of unknown function DUF1365  35.27 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003862  hypothetical protein  31.03 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0087  hypothetical protein  31.89 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3432  hypothetical protein  32.95 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6582  hypothetical protein  32.95 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0724  hypothetical protein  31.15 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00450807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0912  hypothetical protein  33.74 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2938  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064452  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1389  hypothetical protein  31.89 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01817  hypothetical protein  35.67 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1621  protein of unknown function DUF1365  31.8 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1046  protein of unknown function DUF1365  34.3 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.616737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1054  protein of unknown function DUF1365  32.08 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2970  hypothetical protein  34.27 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  0.71112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2397  protein of unknown function DUF1365  34.27 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1442  protein of unknown function DUF1365  31.65 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3929  hypothetical protein  33.89 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1617  hypothetical protein  30.98 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.67 
 
 		 658 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5829  hypothetical protein  30.19 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4019  hypothetical protein  33.05 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0349  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.99 
 
 		 656 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2753  hypothetical protein  31.95 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.948566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1803  protein of unknown function DUF1365  31.17 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000430371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0491  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1090  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein  31.91 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  30.58 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1891  protein of unknown function DUF1365  29.96 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0272  hypothetical protein  32.5 
 
 		 258 aa  95.9  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.944039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2024  protein of unknown function DUF1365  30.3 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1450  hypothetical protein  31.25 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0326  hypothetical protein  30.34 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2361  hypothetical protein  29.49 
 
 		 242 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0297  protein of unknown function DUF1365  33.78 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6097  hypothetical protein  30.51 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0297528  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5885  hypothetical protein  33.06 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192815  normal  0.239276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0368  protein of unknown function DUF1365  31.17 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0235  hypothetical protein  30.83 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1972  hypothetical protein  29.88 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39839  predicted protein  31.8 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00891557  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48601  predicted protein  29.51 
 
 		 360 aa  85.5  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2121  protein of unknown function DUF1365  28.33 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000114198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0413  hypothetical protein  31.38 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00475452  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0101  protein of unknown function DUF1365  28.68 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00443517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10454  hypothetical protein  31.25 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0463  hypothetical protein  31.98 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0729  hypothetical protein  24.15 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0740  hypothetical protein  27.22 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4926  hypothetical protein  29.27 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1819  hypothetical protein  28.11 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1251  protein of unknown function DUF1365  33.55 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00207378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4370  hypothetical protein  28.76 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.686626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4457  hypothetical protein  28.76 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163875  normal  0.0342696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2920  hypothetical protein  32.19 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>