104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0724 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0724  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00450807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1870  hypothetical protein  57.42 
 
 
268 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.651772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0087  hypothetical protein  48.36 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1556  hypothetical protein  50.19 
 
 
267 aa  249  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2905  hypothetical protein  52.63 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3572  hypothetical protein  47.69 
 
 
271 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2566  hypothetical protein  50.61 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2839  protein of unknown function DUF1365  52.05 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1621  protein of unknown function DUF1365  47.15 
 
 
283 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3929  hypothetical protein  50.6 
 
 
280 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1442  protein of unknown function DUF1365  49.6 
 
 
283 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2555  hypothetical protein  45.77 
 
 
276 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1389  hypothetical protein  45.91 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4843  hypothetical protein  45 
 
 
258 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49195  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2024  protein of unknown function DUF1365  45.21 
 
 
265 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1803  protein of unknown function DUF1365  42.29 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000430371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3432  hypothetical protein  38.8 
 
 
292 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1891  protein of unknown function DUF1365  39.93 
 
 
264 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1046  protein of unknown function DUF1365  40.48 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.616737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0912  hypothetical protein  40.16 
 
 
254 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1617  hypothetical protein  41.18 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1450  hypothetical protein  41.18 
 
 
261 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2970  hypothetical protein  41.15 
 
 
272 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  0.71112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2397  protein of unknown function DUF1365  41.15 
 
 
272 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0326  hypothetical protein  39.11 
 
 
250 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101488  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6582  hypothetical protein  38.6 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1972  hypothetical protein  37.26 
 
 
261 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0235  hypothetical protein  38.19 
 
 
272 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2361  hypothetical protein  37.25 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0463  hypothetical protein  37.45 
 
 
276 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1090  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein  38.19 
 
 
249 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5829  hypothetical protein  36.12 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2753  hypothetical protein  38.19 
 
 
249 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.948566  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2938  hypothetical protein  37.01 
 
 
249 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064452  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0491  hypothetical protein  37.86 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1054  protein of unknown function DUF1365  35.18 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4019  hypothetical protein  36.19 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5885  hypothetical protein  36.4 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192815  normal  0.239276 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6097  hypothetical protein  35.36 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0297528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1002  hypothetical protein  31.4 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.160897  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  35.77 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0413  hypothetical protein  35.02 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00475452  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1483  hypothetical protein  31.3 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0368  protein of unknown function DUF1365  33.73 
 
 
252 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1819  hypothetical protein  37.34 
 
 
291 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2773  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725138  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0101  protein of unknown function DUF1365  37.3 
 
 
265 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00443517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4926  hypothetical protein  34.44 
 
 
269 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10454  hypothetical protein  32.93 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4268  protein of unknown function DUF1365  36.73 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2099  hypothetical protein  34.26 
 
 
241 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2121  protein of unknown function DUF1365  32.65 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000114198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4370  hypothetical protein  35.37 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.686626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0272  hypothetical protein  32.93 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.944039  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4457  hypothetical protein  35.37 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163875  normal  0.0342696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4751  hypothetical protein  34.36 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01778  hypothetical protein  31.27 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0297  protein of unknown function DUF1365  34.2 
 
 
263 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0957  hypothetical protein  33.74 
 
 
266 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0873  hypothetical protein  27.89 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2097  hypothetical protein  31.15 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4071  hypothetical protein  26.44 
 
 
261 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2920  hypothetical protein  35.12 
 
 
228 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3174  hypothetical protein  32.38 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186988  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.4 
 
 
658 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1384  hypothetical protein  29.28 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2467  hypothetical protein  29.46 
 
 
276 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3369  hypothetical protein  27.76 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1488  hypothetical protein  32.7 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1067  hypothetical protein  30.68 
 
 
266 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3380  hypothetical protein  28.14 
 
 
263 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1251  protein of unknown function DUF1365  31.16 
 
 
291 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00207378  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0128  hypothetical protein  32.81 
 
 
259 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4740  hypothetical protein  31.87 
 
 
271 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01432  hypothetical protein  29.89 
 
 
247 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3064  hypothetical protein  29.12 
 
 
274 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1170  hypothetical protein  28.14 
 
 
264 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3050  hypothetical protein  28.74 
 
 
274 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3032  hypothetical protein  25.65 
 
 
273 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0801667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0349  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.06 
 
 
656 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1169  hypothetical protein  27.76 
 
 
263 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1313  protein of unknown function DUF1365  28.35 
 
 
274 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.91577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003862  hypothetical protein  26.61 
 
 
272 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3207  hypothetical protein  28.35 
 
 
274 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1240  hypothetical protein  27.76 
 
 
263 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1176  protein of unknown function DUF1365  31.25 
 
 
247 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1117  hypothetical protein  35.05 
 
 
227 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  34.34 
 
 
667 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2710  hypothetical protein  27.65 
 
 
269 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.784131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2735  hypothetical protein  30.33 
 
 
269 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3018  hypothetical protein  30.04 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1486  hypothetical protein  28.63 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.735841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4723  protein of unknown function DUF1365  30.6 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0639  hypothetical protein  28.63 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000143987  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39839  predicted protein  30.35 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00891557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01817  hypothetical protein  28.63 
 
 
242 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0461  hypothetical protein  30.99 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1955  protein of unknown function DUF1365  32.93 
 
 
255 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1327  hypothetical protein  23.43 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0815  hypothetical protein  26.62 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>